ฟักทองมีสารต้าน อนุมูลอิสระ ในระดับสูง เหล่านี้คือโมเลกุลที่ต่อกรกับอนุมูลอิสระ ที่เป็นอันตราย (โมเลกุลที่ไม่เสถียรประเภทหนึ่งซึ่งบางครั้งอาจทำให้เซลล์ของเราเสียหายซึ่งอาจทำให้เกิดความชราและนำไปสู่โรคต่างๆเมื่อเวลาผ่านไป) ในขณะที่สารต้านอนุมูลอิสระบางชนิดเกิดขึ้นตามธรรมชาติในร่างกายของเราแต่บางชนิดก็ได้รับจากผักและผลไม้