มะเร็งไตเซลล์ใสเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงในโครโมโซม 3 มะเร็งอาจเกี่ยวข้องกับการลบส่วนหนึ่งของแขน p หรือการย้ายข้อมูลทางพันธุกรรมหรือสำเนา โครโมโซมร่างกาย ที่หายไป การเปลี่ยนแปลงที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งไตชนิดเซลล์ใสนั้นไม่ได้รับการสืบทอดและเกิดขึ้นเป็นระยะๆ