ในการวิเคราะห์โครโมโซม โครโมโซม จะถูกย้อมสีเพื่อสร้างรูปแบบแถบที่สามารถใช้เพื่อตรวจจับการเปลี่ยนแปลงของการจัดเรียงโครงสร้างภายในหรือระหว่างโครโมโซม ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับการแตกหักของโครโมโซมและการจัดเรียงใหม่ภายในโครโมโซมหรือกับโครโมโซมอื่นตั้งแต่สองตัวขึ้นไป ซึ่งอาจส่งผลให้โครโมโซมไม่สมดุลหากได้รับวัสดุโครโมโซม (การกลายพันธุ์แบบแทรก) หรือสูญหาย (การกลายพันธุ์แบบลบ) ในระหว่างกระบวนการ