การจัดเรียงตัวของกรดอะมิโนในคอลลาเจน คอลลาเจน ประกอบด้วยกรดอะมิโนเฉพาะ – Glycine , Proline, Hydroxyproline และ Arginine กรดอะมิโนเหล่านี้มีการจัดเรียงอย่างสม่ำเสมอในแต่ละสามสายของหน่วยย่อยของคอลลาเจนเหล่านี้ ลำดับมักจะเป็นไปตามรูปแบบ Gly-Pro-X หรือ Gly-X-Hyp โดยที่ X อาจเป็นกรดอะมิโนอื่นๆ ที่ตกค้าง โพรลีนหรือไฮดรอกซีโพรลีนประกอบด้วยประมาณ 1/6 ของลำดับทั้งหมด
ไกลซีนคิดเป็น 1/3 ของลำดับ หมายความว่าประมาณครึ่งหนึ่งของลำดับคอลลาเจนไม่ใช่ไกลซีน โพรลีน หรือไฮดรอกซีโพรลีน นอกจากนี้ การทำซ้ำอย่างสม่ำเสมอและปริมาณไกลซีนสูงยังพบได้ในโปรตีนเส้นใยอื่นๆ เพียงไม่กี่ชนิด เช่น ไหมไฟโบรอิน
| 
