เซลล์โปรคารีโอตและยูคาริโอตแตกต่างกันในลักษณะอื่นๆ มากมาย รวมถึงองค์ประกอบของไขมัน โครงสร้างของเอนไซม์เมตาบอลิซึมที่สำคัญ การตอบสนองต่อยาปฏิชีวนะและสารพิษ และกลไกการแสดงออกของข้อมูลทางพันธุกรรม สิ่งมีชีวิตยูคารีโอตมีโครโมโซมเชิงเส้นหลายตัวพร้อมยีนที่ใหญ่กว่าที่จำเป็นในการเข้ารหัสการสังเคราะห์โปรตีน ส่วนสำคัญของสำเนาของกรดไรโบนิวคลีอิก (RNA) ของข้อมูลทางพันธุกรรม (กรดดีออกซีไรโบนิวคลีอิกหรือ DNA) จะถูกทิ้งไป และ RNA ของผู้ส่งสาร (mRNA) แบคทีเรีย ที่เหลือจะถูกดัดแปลงอย่างมากก่อนที่จะแปลเป็นโปรตีน ในทางตรงกันข้าม แบคทีเรียมีโครโมโซมวงกลมหนึ่งแท่งที่มีข้อมูลทางพันธุกรรมทั้งหมดของพวกมัน และ mRNA ของพวกมันก็เป็นสำเนาที่ถูกต้องของยีนของพวกมันและไม่ถูกดัดแปลง