SARS-CoV-2 หลายสายพันธุ์เกิดขึ้นระหว่างการระบาดใหญ่ ตัวอย่างเช่น ในช่วงกลางปี ​​2021 การเกิดขึ้นของสิ่งที่เรียกว่าสายพันธุ์เดลต้า ซึ่งแพร่ระบาดได้มากกว่าไวรัสรูปแบบเดิม นำไปสู่การแพร่ระบาดของผู้ที่ได้รับวัคซีน และเป็นสาเหตุสำคัญของการเจ็บป่วยและการรักษาตัวในโรงพยาบาลของผู้ที่ไม่ได้รับการฉีดวัคซีน . ในทำนองเดียวกัน ในช่วงปลายปี พ.ศ. 2564 สายพันธุ์ที่ชื่อว่า Omicron กลายเป็นสายพันธุ์ที่โดดเด่นของไวรัสในหลายพื้นที่ รวมถึงสหราชอาณาจักรและสหรัฐอเมริกา ไวรัสโคโรนา ในขณะที่สายพันธุ์ Omicron แพร่เชื้อได้มากกว่าสายพันธุ์ Delta อย่างมีนัยสำคัญ Omicron ก่อให้เกิดความเจ็บป่วยที่รุนแรงน้อยกว่าในคนส่วนใหญ่ อย่างไรก็ตาม เช่นเดียวกับเดลต้า มันเป็นสาเหตุหลักของการรักษาตัวในโรงพยาบาลในผู้ที่ไม่ได้รับวัคซีน