ตัวแทนของการติดเชื้อสามารถแบ่งออกเป็นกลุ่มต่างๆ ตามขนาด ลักษณะทางชีวเคมี หรือลักษณะที่พวกมันมีปฏิสัมพันธ์กับมนุษย์ กลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่ก่อให้เกิดโรคติดเชื้อ แบ่งเป็น แบคทีเรีย ไวรัส เชื้อรา และปรสิตแบคทีเรียสามารถอยู่รอดได้ภายในร่างกาย แต่อยู่ภายนอกเซลล์แต่ละเซลล์ แบคทีเรียบางชนิดซึ่งจัดอยู่ในประเภทแอโรบิกต้องการออกซิเจนในการเจริญเติบโต ในขณะที่แบคทีเรียบางชนิด เช่น แบคทีเรียที่พบในลำไส้เล็กของคนที่มีสุขภาพดี จะเติบโตได้ก็ต่อเมื่อไม่มีออกซิเจนเท่านั้น จึงเรียกว่าแอนแอโรบิก การติดเชื้อ แบคทีเรียส่วนใหญ่ล้อมรอบด้วยแคปซูลที่ดูเหมือนจะมีบทบาทสำคัญในความสามารถในการสร้างโรค นอกจากนี้ แบคทีเรียหลายชนิดยังปล่อยสารพิษที่อาจทำลายเนื้อเยื่อได้ โดยทั่วไปแล้วแบคทีเรียจะมีขนาดใหญ่พอที่จะมองเห็นได้ด้วยกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง Streptococci แบคทีเรียที่ทำให้เกิดไข้อีดำอีแดงมีเส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ 0.75 ไมโครเมตร (0.00003 นิ้ว) สไปโรเชเตสซึ่งเป็นสาเหตุของซิฟิลิส โรคฉี่หนู และไข้หนูกัด มีความยาว 5 ถึง 15 ไมโครเมตร การติดเชื้อแบคทีเรียสามารถรักษาได้ด้วยยาปฏิชีวนะ