ระบบประสาทอัตโนมัติควบคุมการทำงานของกล้ามเนื้อหัวใจ เช่น กล้ามเนื้อเรียบที่อยู่ในกระเพาะอาหารและในต่อมและอวัยวะอื่นๆ เส้นประสาทอัตโนมัติควบคุมการทำงานที่ไม่ได้อยู่ภายใต้การควบคุม ประสาทส่วนกลาง กล่าวคือ ไม่ได้ตั้งใจ ระบบประสาทอัตโนมัติแบ่งการทำงานออกเป็น 2 ส่วน ได้แก่ ระบบประสาทซิมพาเทติก รับผิดชอบอัตราการเต้นของหัวใจเพื่อเร่งความเร็วและตอบสนองการบินหรือการต่อสู้ที่เกี่ยวข้อง ระบบประสาทกระซิก ควบคุมกิจกรรมต่าง ๆ เช่น การขับถ่าย การย่อยอาหาร และการเผาผลาญที่เกี่ยวข้อง