โดยที่ผู้ป่วยส่วนใหญ่ไม่รู้ตัวว่าตนเองติดเชื้อ เหตุการณ์เหล่านี้เกิดขึ้นอย่างเด่นชัดในเนื้อเยื่ออื่นที่ไม่ใช่เลือดส่วนปลาย โดยเฉพาะในระบบทางเดินอาหาร ซึ่งการพร่องของ CD4 + จำนวนมากทีเซลล์เกิดขึ้นนานก่อนที่ผลเสียของการติดเชื้อเอชไอวีจะปรากฏเป็นอย่างอื่น โรคเอชไอวี ข้อมูลเชิงลึกที่ลึกซึ้งเกี่ยวกับเหตุการณ์แรกเริ่มเหล่านี้ได้มาจากการใช้แบบจำลองไพรเมตที่ไม่ใช่มนุษย์ ซึ่งให้โอกาสในการตรวจสอบระยะแรกของการติดเชื้อไวรัสซิมเมียน (SIV)