อย่างไรก็ตาม แม้ว่ายายับยั้งจุดตรวจภูมิคุ้มกันมีแนวโน้มว่าจะมีประสิทธิภาพในระยะยาว ผลประโยชน์ของยาเหล่านี้ต่อประชากรโดยรวมยังต่ำมาก เช่น ความถี่ของการตอบสนองต่ำในเนื้องอกทั่วไปบางชนิด เช่น เต้านมและต่อมลูกหมาก และความแตกต่างในระดับของ โรคเริม การตอบสนองของเนื้องอกที่แตกต่างกันในผู้ป่วยรายเดียวกัน ทำให้ภูมิคุ้มกันบำบัดมีข้อจำกัดและความท้าทายมากมาย ผู้ป่วยส่วนใหญ่ไม่ตอบสนองต่อการบำบัดด้วยภูมิคุ้มกันหรือมีความต้านทานต่อการรักษาอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้หลังจากการรักษาไประยะหนึ่ง